O transplante de córnea requer um grande período de recuperação, próximo a 12 meses. Este transplante também corre risco de rejeição e não impede que o ceratocone volte a aparecer. Na maioria das vezes o uso de óculos ou lentes de contato se faz necessário e o paciente ainda pode estar sujeito ao Implante de Anel de Ferrara para a correção de alto grau de astigmatismo irregular que pode surgir por uma má recuperação do transplante.
